1、籌資的目的不同

吸收存款在一定意義上是全面擴大銀行資金來源的總量，而發行債券則著眼于增長長期資金來源和滿足特定用途的資金需要。

2、籌資機制不同

吸收存款是經常性的、無限額的，而金融債券的發行是集中的、有限額的。在存款市場上，商業銀行在很大程度是處在被動地位，存款規模取決于存款者的意愿，因而存款市場屬于買方市場性質。而發行金融債券的主動權在銀行手中，因而它屬于賣方市場，是銀行的“主動負債”。

3、籌資的效率不同

由于金融債券的利率高于存款的利率，對客戶具有較強的吸引力，因而其籌資的效率在一般情況下高于存款。

4、所籌集資金的穩定性不同

金融債券一般都具有明確的償還期，因而資金的穩定性強;存款的期限具有較大的彈性，即便是定期存款，在特定的狀況下也可提前支取，因而資金的穩定性較差。

5、資金流動性不同

金融債券一般不記名，有廣泛的二級市場流通轉讓，具有較強的流動性。而存款，一般都是記名式的，資金一旦轉化為存款，債權債務關系便被固定在銀行和客戶之間，因而資金的流動性差。

6、受影響不同

吸收存款受到的準備金率的影響，而金融債券獲得的資金則不受其影響。